MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae HS11286 plasmid pKPHS2

Total Repeats: 275

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016846	GCG	2	6	455	460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_016846	CTG	2	6	465	470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_016846	TAC	2	6	497	502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_016846	TCC	2	6	503	508	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_016846	TTA	2	6	593	598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016846	CGT	2	6	610	615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_016846	CA	3	6	661	666	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_016846	AGG	2	6	909	914	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_016846	CAT	2	6	1207	1212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_016846	GTGG	2	8	2163	2170	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016846	TCC	2	6	3435	3440	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_016846	TCCT	2	8	5427	5434	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_016846	AAAAC	2	10	6652	6661	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_016846	TCAG	2	8	6690	6697	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_016846	TA	3	6	6701	6706	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016846	CTG	2	6	9561	9566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_016846	CCT	2	6	9569	9574	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_016846	TGA	2	6	10679	10684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016846	ATC	2	6	10759	10764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_016846	ATGA	2	8	10788	10795	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016846	AGG	2	6	11871	11876	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016846	TAAA	2	8	11892	11899	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016846	ATCCA	2	10	12382	12391	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
24	NC_016846	CGG	2	6	13530	13535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_016846	GCG	2	6	13873	13878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_016846	AGG	2	6	15260	15265	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016846	CCG	2	6	15880	15885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_016846	CGG	2	6	15892	15897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_016846	GGT	2	6	17917	17922	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016846	ATC	2	6	17932	17937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_016846	ATA	2	6	20294	20299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016846	ATC	2	6	21449	21454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_016846	CAC	2	6	21463	21468	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_016846	CGC	2	6	21469	21474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_016846	GCGG	2	8	21479	21486	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
36	NC_016846	ACCA	2	8	21495	21502	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_016846	GGC	3	9	21572	21580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_016846	CT	3	6	21582	21587	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_016846	GCG	2	6	21626	21631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_016846	CG	3	6	21630	21635	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_016846	GAC	2	6	21645	21650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_016846	GCC	2	6	21665	21670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_016846	T	6	6	23008	23013	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016846	CCT	2	6	23257	23262	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_016846	AT	3	6	23769	23774	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016846	A	6	6	23814	23819	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016846	CTG	2	6	24501	24506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_016846	AGC	2	6	24590	24595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_016846	TCAC	2	8	24624	24631	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_016846	TCGC	2	8	25207	25214	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
51	NC_016846	A	6	6	25283	25288	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016846	GCTAA	2	10	25295	25304	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
53	NC_016846	GCAA	2	8	25441	25448	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_016846	T	6	6	29193	29198	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_016846	CG	3	6	29249	29254	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56	NC_016846	TGCTC	2	10	29257	29266	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
57	NC_016846	AAC	2	6	29321	29326	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_016846	CGTT	2	8	29611	29618	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_016846	ACTC	2	8	29691	29698	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_016846	ATC	2	6	30203	30208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_016846	TTA	2	6	30212	30217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_016846	TAA	2	6	30228	30233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_016846	ATC	2	6	30559	30564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_016846	ATC	2	6	31506	31511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_016846	TTA	2	6	31558	31563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_016846	TTTTC	2	10	31585	31594	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
67	NC_016846	ACA	2	6	31620	31625	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_016846	TGA	3	9	31779	31787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_016846	GGT	2	6	31808	31813	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_016846	TTA	2	6	36985	36990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_016846	CTGA	2	8	37028	37035	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
72	NC_016846	CA	3	6	37053	37058	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_016846	CTG	2	6	37061	37066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_016846	CCCTG	2	10	37244	37253	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
75	NC_016846	GAA	2	6	37280	37285	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_016846	ACG	2	6	37333	37338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_016846	GCG	2	6	37365	37370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_016846	GCT	2	6	37588	37593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_016846	GAA	2	6	37608	37613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_016846	AGT	2	6	37615	37620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_016846	ACA	2	6	37622	37627	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_016846	CAT	2	6	37630	37635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_016846	TGT	2	6	37645	37650	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_016846	GCG	3	9	37670	37678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_016846	GTG	2	6	37686	37691	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_016846	CTGG	2	8	37703	37710	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
87	NC_016846	ATG	2	6	37729	37734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_016846	GCCG	2	8	38194	38201	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
89	NC_016846	T	6	6	38204	38209	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_016846	AAGG	2	8	38210	38217	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_016846	GAA	2	6	39230	39235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_016846	TCA	2	6	39277	39282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_016846	ACTCT	2	10	39323	39332	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
94	NC_016846	GCA	2	6	39334	39339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_016846	TAC	2	6	39674	39679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_016846	CA	3	6	39702	39707	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_016846	TTAAT	2	10	39708	39717	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_016846	A	6	6	39745	39750	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_016846	TGG	2	6	40257	40262	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_016846	G	6	6	40261	40266	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
101	NC_016846	A	6	6	40282	40287	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_016846	GCTAA	2	10	40294	40303	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
103	NC_016846	AAGT	2	8	40417	40424	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_016846	ATA	2	6	41570	41575	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_016846	AAT	2	6	41700	41705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_016846	AT	3	6	42604	42609	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_016846	GATT	2	8	42616	42623	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_016846	TTTAA	2	10	42636	42645	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_016846	ACG	2	6	42797	42802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_016846	CTTT	2	8	43793	43800	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
111	NC_016846	GTC	2	6	43817	43822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_016846	TCTG	2	8	45130	45137	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
113	NC_016846	ATG	2	6	45149	45154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_016846	TAA	2	6	45899	45904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_016846	CTA	2	6	45908	45913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_016846	TCCTGC	2	12	45935	45946	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
117	NC_016846	T	7	7	46676	46682	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_016846	GAA	2	6	54324	54329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_016846	CCG	2	6	55142	55147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_016846	GGC	2	6	55150	55155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_016846	AAAT	2	8	55174	55181	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_016846	ATT	2	6	55219	55224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_016846	GAAT	2	8	55229	55236	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_016846	TA	3	6	56102	56107	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_016846	AAT	2	6	56153	56158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_016846	ACC	2	6	56188	56193	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_016846	AC	3	6	62218	62223	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_016846	GCA	2	6	63841	63846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_016846	CCCT	2	8	65812	65819	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
130	NC_016846	GA	3	6	66504	66509	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_016846	TAA	2	6	71640	71645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_016846	AAG	2	6	71651	71656	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_016846	ATT	2	6	72078	72083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_016846	T	7	7	72109	72115	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_016846	TCT	2	6	72133	72138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_016846	T	6	6	72163	72168	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_016846	TGC	2	6	72867	72872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_016846	TA	3	6	73467	73472	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_016846	GAAT	2	8	73478	73485	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_016846	TTTC	2	8	73487	73494	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
141	NC_016846	T	8	8	74379	74386	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_016846	ATTT	2	8	77853	77860	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_016846	AT	3	6	77880	77885	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_016846	ATG	2	6	77903	77908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
145	NC_016846	T	6	6	78086	78091	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_016846	TAA	2	6	78162	78167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_016846	GGA	2	6	78178	78183	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
148	NC_016846	AAAC	2	8	78193	78200	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
149	NC_016846	ATT	2	6	78221	78226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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152	NC_016846	CAA	2	6	79042	79047	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
153	NC_016846	ATT	2	6	79115	79120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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273	NC_016846	CAA	2	6	110437	110442	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
274	NC_016846	G	6	6	110448	110453	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
275	NC_016846	AAAT	2	8	110459	110466	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.